天然祖母绿与合成祖母绿的区别则大多数需要在实验室内进行，鉴定天然祖母绿的方法有：


一、 一般天然祖母绿的折光率在1.57－1.59之间，而合成祖母绿一般小于1.57，折光率较低，但有例外的情况。


二、 天然祖母绿一般比重大于2.7，较大。而熔融法合成的祖母绿，比重只有2。65－2.66左右。但要注意的是，水热　合成的祖母绿也有比重较高的。


三、 天然祖母绿大多会有瑕疵及三相包裹体，针状、柱状、粒状的结晶矿物包裹体等。而合成的祖母绿则往往比较干净，水热法合成的祖母绿包裹体，呈“窗纱状”，熔融法合成的祖母绿的包裹体呈面包屑状。天然与合成祖母绿的包裹体特征不同。


四、 天然祖母绿在紫外线下反应比较迟钝，或呈暗红色，而合成祖母绿则往往发强红色荧光。做此项测试时一般应与标准样进行对照。